陈燕1 刘军2 莫之婧1
1. 金沙js3777入口检测广西高校生物化学与分子生物学重点实验室 2. 桂林优利特医疗电子有限公司
摘要：目的：应用生物信息学方法挖掘肝硬化-肝癌演变的关键基因，并探究其机制。方法：使用GEO2R,从数据集GSE6764中筛选出在肝硬化组织和极早期肝癌组织中差异表达的基因，随后进行GO和KEGG分析；构建蛋白质-蛋白质相互作用网络后通过Cytoscape软件中的MCODE插件检测网络中最显著模块所含关键基因；对关键基因进行聚类分析和预后分析。结果：共筛选出169个差异表达基因，其中表达上调和下调的基因数目分别为19个和150个。MCODE筛选后获得16个关键基因，主要与细胞因子和免疫等因素相关，其中关键基因MPEG1与肝癌患者无病生存期相关。结论：本研究发现的关键基因，有助于认识肝硬化-肝癌的演变机制，并可作为早期肝癌防治的潜在标志物。
关键词：肝硬化;肝癌;生物信息学;
DOI：10.19296/j.cnki.1008-2409.2022-06-001
PDF下载：点击下载
