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肾癌中THBS家族基因表达数据生物信息学挖掘

【来源:《华夏医学》编辑部 | 作者:刘红云等 | 编辑:李佳睿 | 发布日期:2023-12-21】

刘红云1 杨婷1 李国庆1 孟莉娟2

1. 南华大学衡阳医学院基础医学院细胞生物学与遗传学教研室2. 南华大学衡阳医学院附属第二医院超声医学科

摘要:目的:应用生物信息学方法挖掘血小板反应蛋白(THBS)家族各成员与肾癌的关系,预测肾癌治疗、诊断及预后新的标志物。方法:运用ONCOMINE、GEPIA、KM-plotter及cBioPortal等数据库对THBS家族在肾癌中的mRNA表达水平及预后生存率进行分析,使用GeneMANIA及DAVID数据库对THBS家族的功能及生物途径进行分析。结果:与正常组织相比,THBS1/THBS2/THBS3在肾癌中的mRNA表达水平下调,且在肾癌肿瘤病理分期中,THBS2/THBS3/THBS5的表达情况与病理分期具有相关性,低水平THBS2/THBS3/THBS4/THBS5或高水平THBS1的肾癌患者预计具有较高总生存率(OS)。结论:THBS1/THBS2/THBS3可能是肾癌患者精准治疗的潜在目标,THBS2/THBS3/THBS4/THBS5可作为肾癌预后新的标志物。关键词:血小板反应蛋白;肾癌;生物信息学;

基金资助:湖南省教育厅科学研究项目(21A0268);湖南省自然科学基金项目(2020JJ4530);衡阳市科学技术项目(2020-67-9);

DOI:10.19296/j.cnki.1008-2409.2023-05-005

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