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肠道病毒C组96型VP1蛋白线性B细胞表位筛选与鉴定

【来源:《华夏医学》编辑部 | 作者:何韵怡等 | 编辑:李佳睿 | 发布日期:2024-09-16】

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1.金沙js3777入口检测医学检验学院2.金沙js3777入口检测第二附属医院检验科3.金沙js3777入口检测第二附属医院科研科4.广东省疾病预防控制中心

摘要:目的 鉴定肠道病毒C组96型(enterovirus C96,EV-C96)VP1蛋白的线性B细胞表位。方法 采用IEDB网站提供的在线分析工具分析、预测EV-C96 VP1蛋白的线性B细胞表位,结合其二级结构、β-转角、抗原性、亲水性等多项参数,筛选出优势候选表位;应用间接ELISA法检测候选表位与EV-C96免疫血清的反应性以及与21种其他常见手足口病病原血清的交叉反应性;应用微量中和试验测定表位抗体的中和效价;采用序列比对分析表位的序列保守性;应用结构对齐分析表位的结构特异性。结果 通过生物信息学筛选出EV-C96 VP1蛋白7个候选表位(P1~P7);ELISA法检测发现P7(氨基酸序列位置为282~304)与EV-C96多克隆抗体有强反应性,与其他常见EV多克隆抗体不发生明显反应;微量中和试验显示,P7抗体的中和效价低于1∶2;序列及结构分析结果显示,P7的氨基酸序列在EV-C96型内具有较高保守性,与其他EV相应位点氨基酸序列的结构有明显差异。结论 P7表位为EV-C96特异的非中和性B细胞表位,可作为开发EV-C96检测试剂盒的候选抗原表位。关键词:肠道病毒C组96型;VP1蛋白;线性B细胞表位;手足口病;

基金资助:国家自然科学基金项目(81660280);广西高校中青年教师科研基础能力提升项目(2023KY0516);广西高校大学生创新创业计划项目(202210601052);

DOI:10.19296/j.cnki.1008-2409.2024-02-001

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